PDB

From Opengenome.net
Revision as of 12:28, 28 June 2006 by Ksjung (talk | contribs)
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)

PDB (Protein Data Bank)

PDB는 실험으로 밝혀진 단백질의 구조와 기능등 단백질 정보를 모아놓은 곳으로 미국의 Brookhaven National Laboratory에서 
운영하고 있다. 단백질 ID, 기능, 발견자, 구조등의 다양한 단백질의 정보를 저장하고 있다.

# PDB 사용목적
1. 관심 단백질의 구조 파악
2. 하나 또는 그 이상의 구조에 대한 분석 수행
3. 부가적인 정보제공
4. 3D 구조와 좌표를 통해 쉽게 알수 있도록 함

# PDB Database 포맷
- PDB format : 커뮤니티에서 널리 사용되는 형식으로, 구조 정보를 분석하는 프로그램의 defort 값으로 되어있다.
- mmCIF format : CIF format을 통해 충분한 데이터 이름을 주어서 단백질 구조를 논문에 사용하며, 
전산상의 문서를 통합하고, 일반성, 호환성및 유연성을 이루고 있다.