FASTA
FASTA
FASTA는 단백질 서열과 염기 서열의 데이터 베이스에서 상동성이 높은 서열 검색을 위해 사용되는 분석 도구로서
염기 서열간의 비교와 단백질 서열간의 비교는 물론 염기 서열과 단백질 서열간의 비교도 가능하다. 질의어와 비교할
데이터베이스의 관계에 따라서 fasta3, fastx3, fasty3, tfastx3, tfasty3으로 나눌수 있다.
# FASTA 데이터 베이스
-DNA : EST, HTG, STS, GSS, nt(nonredundant set)
-Protein : nr(GenBank의 nonredundant CDS translation + PDB + SwissProt + PIR), SwissProt