생정보학책 (BioInformatics Book)
박종화 (Jong Bhak)
BiOcentre: Biological Information Objects
j@bio.cc 2005/9/10
내용 Contents
생정보학책 머리말 Preface
생정보학의 이름 번역에 대해서 Translating bioinformatics
생정보학 기본원칙과 철학 Bioinformatics First principles
생정보학의 역사 Brief history of Bioinformatics
생정보학이란 무엇인가? What is Bioinformatics?
생정보학에서의 체학(Omics)와 네트워크생물학 (망생물학: Network biology)
단백질이란: 생명현상의 가장 핵심적인 정보처리 단위 What is a protein?
- 아미노산: 단백질내의 정보처리 스위치와 구조적 단위 Amino acids: basic information unit of proteins
- 생정보학의 큰 영역 여섯가지 Six large meta-omics in bioinformatics.
- 생정보학의 큰 정보체 여섯가지
단백질와 다른분자들의 표현법 Representing proteins and other molecules
복잡성이 낮은 서열들 Low complexity sequences
단백질 서열의 친족성 Sequence homology
친족성기반 구조 모델만들기 Structure modelling by homology
실꿰기 모델 (단백질 구조인식) Threading (Fold recognition)
막바로 단백질 구조 예측하기 Ab initio protein structure prediction
기초적 친족성 찾기 알고리듬 Basic homology search algorithms
Dynamic Programming search algorithm
서열 파일포멧 Sequence file formats
복수정열 서열 표현 (Multiple sequences representation)
아미노산 친족성 행렬 Amino acid homology matrix
파일포맷 전환 (Parsing file format)
단백질의 성질 표현하기 Representing special characteristics of proteins (sequences)
- Hydrophobicity (Hydropathy plot)
- Secondary structure of proteins
- Accessibility of protein structure.
- Topology of protein structures.
- Flexibility of protein structures.
DNA: the biogrammar of cellular language
생정보학 전산기술 Computing Technology
데이타베이스 Database
알고리듬 Algorithm
- 서열체학 (Sequenceomics)
- 구조체학 (Structomics)
- 발현체학 (Expressomics)
- 상호작용체학 (Interactomics)
- 기능체학 (Functomics)
- 문헌체학 (Textomics)
생정보학책 참고문헌 (References)