단백질의 합성에 관여하는 tRNA 구조의 일부이며 유전암호의 단위인 코돈을 식별하는 부분으로, 인접한 3개의 뉴클레오티드로 이루어져 있다. 뉴클레오티드는 DNA에 함유되는 4종의 염기, 즉 아데닌(A)·티민(T)·구아닌(G)·시토신(C)에 의하여 특징이 나타난다. 따라서, 이 중 3개의 염기배열 방식에 따라 특정 정보를 가진 코돈이 조립된다. 이 정보는 mRNA에 전사되고, 다시 tRNA에 해독되어 코돈에 의하여 규정된 1개의 아미노산이 만들어진다. RNA에는 티민 대신에 우라실(U)이 들어 있다. 안티코돈은 단백질 합성 때 리보솜 위에서 mRNA의 코돈과 상보적(相補的)인 염기쌍을 만들고, 코돈이 지정하는 아미노산을 단백질사슬로 결합한다. 예를 들면, 아미노산의 일종인 알라닌을 운반하는 tRNA에서는 UGC라고 하는 염기배열이 안티코돈이며, 이 부분이 알라닌의 유전암호인 코돈 ACG를 식별하여 이 위치에 알라닌을 결합시켜 단백질사슬을 만든다.