전산생물학
- Computational biology
컴퓨터를 이용하는 생물학이라는 뜻으로 전산생물학 (computational biology)이라는 용어가 사용되어 왔지만, 이 용어는 주로 복잡한 계산이 필요한 생명과학 분야에서 제한적으로 사용되어 왔다. 예를들면 단백질의 구조를 컴퓨터로 연구하는 전산구조생물학 (computational structural biology) 분야가 이에 포함된다.
그 러나 최근(1995년)들어 분자유전학, 분자생물학, 유전공학의 급격한 발전과 유전체사업의 결과로 방대한 생명정보가 축적되자 컴퓨터를 이용하여 체계적인 데이터베이스를 구축하고 이를 효율적으로 분석, 이용하려는 노력이 증대되어 왔다. 그리고 정보화 시대를 맞이하여 정보학이라는 용어가 각광을 받게 되자 최근에 생정보학, 생명정보학, 생물정보학이라는 용어가 새로 등장함.
Computational biology 주요기사
Computational biology 주요 사이트
: 미 국립 생명공학 정보센터에서 만든 이 도구는 서열간의 불완전한 복제 부분의 패턴을 검색하고 생물학적 의미를 갖는 유연관계를 파악하는 도구이다.
: 미 아리조나 대학의 생명트리 프로젝트로서 유전자 정보를 수집하고 목록화 한다.
: 단백질 데이터 베이스와 분석도구를 제공한다.
Computational biology 응용 프로그램
GeneIn
: 한국 유전자데이터베이스(GeneNuri) 및 입력 프로그램(Gene-In).
VMD "Visual Molecular Dynamics" 1.4 beta 1
: 단백질, 핵산, lipid bilayer assemblies 같은 macro- molecule들의 3차 구조를 보여 주고 분석을 위한 프로그램 패키지인 VMD가 Windows에서 실행할 수 있는 1.4 버전을 제공
ProSAL - Protein Sequence Analysis Launcher
: 단백질 서열을 한번 입력해서 여러 개의 단백질 분석이 동시에 가능한 곳. BLAST searches, FASTA3, Pfam, ScanProsite, ScanProfile,ProDom, NetOGlyc 서버 등에서 분석한 결과를 보여 준다
TMPRED
: Transmembrane을 예측해 주는 곳
HMMTOP
: Transmembrane을 예측해 주는 곳
PredictProtein
: Transmembrane을 예측해 주는 곳
Codon usage Database
: CUTG (Codon Usage Tabulated from GenBank)의 웹 버전으로 Genbank에 들어 있는 DNA 서열을 바탕으로 각 종들의 codon 사용 빈도를 검색해 준다.
