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CATH
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<p><font color="#800080" size="4"><strong>CATH</strong></font></p>
<p> CATH는 Protein Structure Classification으로 [[SCOP]]과 유사하게 [[PDB]]에 수록된 3D 구조를 분류한 [[domain]] database이다. domain은 Detective, <br />Puu, Domak과 같은 domain 인식 algorithm으로 정의 되어진다. CATH의 이름은 Class, Architecture, Topology, Homologous superfamily에서 <br />유래되었다. Class는 a-구조,b-구조, ab-구조(위의 a/b와 a+b-구조)와 2차 구조의 조성이 낮은 Few Secondary Structures로 정의 하고 있다. <br /> Atchitecture는 2D 구조의 공간상에서 배열을 연결한 상태를 배제하고 정의한 것으로 ribbon, sheet, sandwich, roll등이 있다. Topology에는 <br />전체 구조가 2D 구조간의 연결 양상을 고려한 분류로 되어있는 Rossmann fold가 있다. Homologous [[superfamily]]는 [[서열 정렬]]과 구조의 비교를 <br />동시에 비교하여 판단한다. <br /> [[서열]]의 [[상동성]]이 높으나 구조의 상동성이 낮거나 그 반대일때 [[단백질]]은 같은 조상으로부터 진화 했을 것이라고 판한하고 있다. <br /><br /><strong><font color="#99cc00">#site</font></strong><br /><a href="http://www.cathdb.info/latest/index.html">http://www.cathdb.info/latest/index.html</a><br /><a href="http://www.cathdb.info/images/cath_logo_left.gif">http://www.cathdb.info/images/cath_logo_left.gif</a></p>
<p> CATH는 Protein Structure Classification으로 [[SCOP]]과 유사하게 [[PDB]]에 수록된 3D 구조를 분류한 [[domain]] database이다. domain은 Detective, <br />Puu, Domak과 같은 domain 인식 algorithm으로 정의 되어진다. CATH의 이름은 Class, Architecture, Topology, Homologous superfamily에서 <br />유래되었다. Class는 a-구조,b-구조, ab-구조(위의 a/b와 a+b-구조)와 2차 구조의 조성이 낮은 Few Secondary Structures로 정의 하고 있다. <br /> Atchitecture는 2D 구조의 공간상에서 배열을 연결한 상태를 배제하고 정의한 것으로 ribbon, sheet, sandwich, roll등이 있다. Topology에는 <br />전체 구조가 2D 구조간의 연결 양상을 고려한 분류로 되어있는 Rossmann fold가 있다. Homologous [[superfamily]]는 [[서열 정렬]]과 구조의 비교를 <br />동시에 비교하여 판단한다. <br /> [[서열]]의 [[상동성]]이 높으나 구조의 상동성이 낮거나 그 반대일때 [[단백질]]은 같은 조상으로부터 진화 했을 것이라고 판한하고 있다. <br /><br /><strong><font color="#99cc00">#site</font></strong><br /><a href="http://www.cathdb.info/latest/index.html">http://www.cathdb.info/latest/index.html</a><br /><a href="http://www.cathdb.info/images/cath_logo_left.gif">http://www.cathdb.info/images/cath_logo_left.gif</a></p>