<p><font color="#800080" size="4"><strong>PHYLIP (Phylogeny Inference Package)<br /></strong></font><br /><font size="2">다중서열 을 분석한이후 분자단위의 계통학적 분석을 위해서는&nbsp;PHYLIP이 많이 사용되고 있다.<br />PHYLIP은 현재 30여개 프로그램으로 이루어진 패키지로서 [[계통발생 ]] 분석의 거의 모든 부분을<br />다루고 있다.&nbsp;<br />PHYLIP은 명령행 프로그램이므로 PAUP처럼 [[PAUP]]처럼 마우스로 하는것이 아니라 명령행을 통해&nbsp;<br />프로그램을 움직이게 된다.&nbsp;<br /><br />- PPRTDIST는 [[PPRTDIST]]는 단백질서열 정렬에 대한 거리행렬을 계산해 주는 프로그램이다.<br />- NEIGHBOR은 PROTDIST[[NEIGHBOR]]은 PROTDIST와 같은 거리행렬 자료를 사용하여 근접군-연결 방법으로 분지도를&nbsp;<br />&nbsp; 생성하는 프로그램이다.<br />- [[FITCH]]는 NEIGHBOR과 비슷하지만 훨씬 강한 분지도 생성 프로그램이다.<br />- [[PROTPARS]]는 단백질 서열에 대해 거리행렬을 이용하지 않고 분지도를 생성하는 프로그램이다.<br />- [[DNADIST]]는 염기서열에서 거리행렬을 계산한다.<br /></font></p>