PHYLIP

PHYLIP (Phylogeny Inference Package)

다중서열 을 분석한이후 분자단위의 계통학적 분석을 위해서는 PHYLIP이 많이 사용되고 있다.
PHYLIP은 현재 30여개 프로그램으로 이루어진 패키지로서 계통발생 분석의 거의 모든 부분을
다루고 있다. 
PHYLIP은 명령행 프로그램이므로 PAUP처럼 마우스로 하는것이 아니라 명령행을 통해 
프로그램을 움직이게 된다. 

- PPRTDIST는 단백질서열 정렬에 대한 거리행렬을 계산해 주는 프로그램이다.
- NEIGHBOR은 PROTDIST