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DALI
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<p><font color="#800080" size="4">DALI</font></p>
<p>DALI는 3D 구조를 적절히 [[정렬]]하는 [[algorithm]]으로 distance matrix를 계산하여 작은 규모의 contact pattern으로 분리하여, 유사한 contact pattern들이 <br />align 하도록 Monte Carlo method로서 최적화 한다. DALI는 3D 구조를 PDB format으로 입력하면 수록된 database와 비교하여 구조적으로 유사한 <br />단백질을 찾아서 보여준다. 또한 [[FSSP]] (Fold classification based on Structure-Structure alignment of Proteins)를 통하여 3D 구조를 중첩된 image와 <br />같은 family의 [[muliplealignmnet]]도 제공하고 있다.<br /><a href="http://www.ebi.ac.uk/dali/dali_web.gif">http://www.ebi.ac.uk/dali/dali_web.gif</a></p>
<p><font color="#99cc00" size="3"><strong># Site</strong></font><br /><a href="http://www.ebi.ac.uk/dali/">http://www.ebi.ac.uk/dali/</a><br /><a href="http://www.ebi.ac.uk/Information/images/dali_small.gif">http://www.ebi.ac.uk/Information/images/dali_small.gif</a></p>
<p>DALI는 3D 구조를 적절히 [[정렬]]하는 [[algorithm]]으로 distance matrix를 계산하여 작은 규모의 contact pattern으로 분리하여, 유사한 contact pattern들이 <br />align 하도록 Monte Carlo method로서 최적화 한다. DALI는 3D 구조를 PDB format으로 입력하면 수록된 database와 비교하여 구조적으로 유사한 <br />단백질을 찾아서 보여준다. 또한 [[FSSP]] (Fold classification based on Structure-Structure alignment of Proteins)를 통하여 3D 구조를 중첩된 image와 <br />같은 family의 [[muliplealignmnet]]도 제공하고 있다.<br /><a href="http://www.ebi.ac.uk/dali/dali_web.gif">http://www.ebi.ac.uk/dali/dali_web.gif</a></p>
<p><font color="#99cc00" size="3"><strong># Site</strong></font><br /><a href="http://www.ebi.ac.uk/dali/">http://www.ebi.ac.uk/dali/</a><br /><a href="http://www.ebi.ac.uk/Information/images/dali_small.gif">http://www.ebi.ac.uk/Information/images/dali_small.gif</a></p>
