DALI
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DALI
DALI는 3D 구조를 적절히 정렬하는 algorithm으로 distance matrix를 계산하여 작은 규모의 contact pattern으로 분리하여, 유사한 contact pattern들이
align 하도록 Monte Carlo method로서 최적화 한다. DALI는 3D 구조를 PDB format으로 입력하면 수록된 database와 비교하여 구조적으로 유사한
단백질을 찾아서 보여준다. 또한 FSSP (Fold classification based on Structure-Structure alignment of Proteins)를 통하여 3D 구조를 중첩된 image와
같은 family의 multialignmnet도 제공하고 있다.
http://www.ebi.ac.uk/dali/dali_web.gif
# Site
http://www.ebi.ac.uk/dali/
http://www.ebi.ac.uk/Information/images/dali_small.gif
