Protein Alignment

단백질 서열의 20개의 아미노산 잔기를 코드화 해놓은 문자표이다. 단백질 서열정렬은 한 서열의 잔기들이 적어도 한개 이상의 다른 
잔기들과 나란히 배열된 상태이다. 두 서열의 최적정렬을 만들기 위해서는 gap이 발생하게 되며 두개의 서열이 정렬될 경우
서로 다른 단백질에서 유사한 기능을 수행함을 암시한다.