모티프

많은 단백질은 하나 또는 그 이상의 모티프(motif)를 가지고 있는데, 이는 이차구조가 특정하게 결합되어 만들어진 것이다. 이것은 특정한 모양을 이루게 되고, 삼차원 구조가 된다.

Coiled-coil motif는 둘, 셋 또는 네 개의 α helix가 서로를 감싸고 있는 모양이다. 이 모티프에서는 α helix의 소수성 부분이 서로 마주 보면서 꼬여 있다. Ca²⁺이 붙어 있는 helix-loop-helix motif는 loop에 친수성 잔기가 있어서 여기에 있는 산소원자와 칼슘이온이 결합하여 생성된 것이다. 또 다른 일반적인 motif는 zinc finger로 α helix 1개와 역평행의 β strand 2개로 이루어져 있다. 아연(zinc)이온에 의해 뭉쳐져서 손가락 모양을 이루기 때문에 zinc finger란 이름이 붙었으며, 주로 RNA나 DNA와 결합된 단백질이 이런 모양을 나타낸다.