기본적으로 southern blot의 기술과 같으며 이것은 DAN- RNA 접합을 이용한 것이다.
이과정에서 유의해야 할 점은 RNA는 DNA와 다르게 RNase에 의해 분해되기가 쉽다. RNase는 상당히 안정한 효소이기 때문에 쉽게 활성을 잃지 않는다. 따라서 시약이나 기구를 사용할때에는 RNase - free라 쓰여있는 것을 사용해야 한다.
