Alignment에서 유전자의 상실로 인한 Gap이 발생할수 있다.<br />이때 진화적으로 처음 Gap의 발생은 어렵지만 Gap이 연장되는것은<br />발생빈도가 높으므로 낮은 penalty를 받게 된다.<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ<br />A&nbsp; T&nbsp; G&nbsp;C G T&nbsp; A&nbsp; C T&nbsp; G<br />│││││││&nbsp; :&nbsp; ││<br />A&nbsp; T&nbsp; G&nbsp; C G T A&nbsp; A&nbsp; T&nbsp; G<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ