표식방법에 관하여 marker를 특이항체에 직접 표시하는 직접 표시법과 특이항체 (일차 항체) 에 대한 항체 (이차 항체 : 예를 들면 항마우스 IgG 항체) 에 표식하는 간접 표식법이 있다. 직접 표식법은 항원항체 반응이 1회에 한정하기 때문에 조작의 간격시간이 짧고, 비특이적인 염색도 적게 나타난다. 반면, 각종 항체에 효소를 표식하는 한편, 그리고 표식 반응에 의해서 항체가 활성이 낮아지는 경우도 적다. 간적 표식법은 일차 항체를 작제한 동물종에 대한 표식 이차 항체를 사용하기 위하여서는 시판되어지는 제품이 있다. 반응이 증강되어 강한 염색상이 관찰되어진다. 한편, 작업 간격과 시간이 걸리며 비특이적인 반응이 나타나기 쉽다. 항원의 검출 감도를 높이기 위하여 아주 다양한 간접 효소 항체법이 고안되어 있다. 그러한 대표적인 예로서는 AB법과 PAP법이 있다.&nbsp;<br />

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