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면역 침강법에서 가장 중요한 point는 이용하는 항체의 물질로서 항체에 대한 특이성이 높고, 아주 높은 친화성으로 반응하는 항체를 선택하지 않으면 안된다. 특히 단백질의 부분 peptide를 화학적으로 합성하고, 거기에 대한 항체를 작성한 경우나 천연 단백질과는 다른 protein과 재조합 단백질을 항원으로서 이용한 경우, Western blotting에서 반응하는 것, 용액 중에서는 천연 단백질과 결합하지 않는 항체가 만들어져 있기 때문에 각각의 방법에서 항체의 성질을 조사하여 미리 check하여 둘 필요가 있다.<br />