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<p><font color="#484804" size="2">박테리아 오페론 유전자와는 달리 개개의 진핵 유전자는 대부분 그 자체의 발현 조절 염기서열 세트를 갖고 있다. 또한 진핵생물에서는 활성자 단백질이 억제자보다 더 중요한 역할을 하는 것으로 보인다. 진핵 유전자의 발현에는 RNA 중합효소외에 전사인자(transcription factor)라고 하는 조절단백질들이 관여하는데, 이 중 한가지 유형이 활성자이다. 유전자의 전사를 시작하는 첫 번째 단계는 활성자가 유전자로부터 멀리 떨어져 있는 엔헨서(enhancer)라고 하는 DNA 서열과 결합하는 것이다. 그러면 DNA는 휘어지고 활성자는 다른 전사인자와 작용하여 복합체를 이루어 프로모터와 붙게 된다. 이 커다란 단백질 조합체는 RNA 중합효소를 프로모터와 정확히 결합하게 하여 전사가 시작되도록 촉진한다. 요약하면, 진핵생물과 원핵생물은 근본적으로 유사한 방법으로 전사를 조절한다. 둘 다 DNA와 결합하는 조절단백질을 이용한다. 그러나원핵생물에 비해 진핵생물에서는 훨씬 더 많은 조절단백질들이 관여하고, 이들 단백질들간의 상호작용은 매우 복잡하다<br /><br /><br /></font></p>
<p><font color="#484804" size="2">동식물이 갖고 있는 유전자들은 내부에 긴 비암호 부위를 포함하고 있고, 이것을 인트론(intron)이라고 한다. 코딩 부위 즉 암호화되어 있는 부위는 엑손(exon)이라 하며 유전자가 발현되는 부분이다. 엑손과 인트론은 모두 DNA로부터 RNA로전사된다. 그러나 RNA가 핵을 떠나기 전에 인트론은 제거되고, 엑손끼리 연결되어 연속적으로 암호화된 서열을 갖는 mRNA 분자를 만든다. 이 과정을 RNA 스플라이싱(RNA splieing)이라 하며 진핵생물 세포가 rRNA와 리보솜 RNA 그리고mRNA를 만들 때 사용한다. </font></p>
<p><font color="#484804" size="2">생물학자들은 RNA 스플라이싱이 다음의 두 가지의 방법에 의해 일어났음을 밝혔는데, 한가지는 RNA 스플라이싱 과정이 주로 단백질과 작은 RNA 분자들로 이루어진 복합체에 의해 촉진된다는 것이며 다른 한가지는 단백질과 다른 RNA 분자 없이도 완전하게 일어난다는 것이다.<br /><br /><br />해독 과정 중에도 유전자 발현이 조절 될 수 있다. 해독에 관여하는 분자들 중 조절기능을 갖고 있는 단백질들이 많이 있다. 예를 들어 적혈구 세포는 헤모글로빈의 기능에 필수적인 철 함유 화합물인 헴(heme)이 세포내에 존재하지 않을 때 헤모글로빈 mRNA의 해독을 방해하는 억제 단백질을 갖고 있다. 억제인자(inhibitor)에 헴이 붙으면 억제인자가 불활성화 되고 헤모글로빈 유전자가 해독된다. 만들어진 폴리펩티드들은 헴 그룹과 붙어서 헤로글로빈 분자가 된다. 유전자 발현 조절을 위한 마지막 기회는 해독 후에 있다. 진핵생물에서는 해독 이후 종종 폴리펩티드를 절단하여 작고 활성이 있는 최종 산물로 만드는데 이것이 여기에 속한다. 인슐린 호르몬의 경우 처음에는 하나의 긴 폴리펩티드로 만들어지며 호르몬으로서의 활성은 갖지 못한다. 중간에 있는 큰 부분이 잘려 나가서 두 개의 짧은 폴리펩티드가 생기며 이들은 황 원자끼리의 화확결합에 의해 함께 연결된다. 마침내 두 개의 짧은 폴리펩티드가 조합을 이루어 활성화된 인슐린이 된다.<br /><br /><br />신호를 전달하는 세포로부터 신호를 전달받는 표적세포로 단백질이나 어떤 다른 종류의 물질을 전달하는 세포간 전달은 발생에서 가장 중요한 기작이다. 대부분의 경우 신호물질은 표적세포의 원형질막에 존재하는 수용체 단백질과 결합하여 세포가 신호전달을 시작하도록 한다. 신호전달경로(signal transduction pathway)란 표적세포 표면에 있는 신호를 세포내부에서 전달받아 이 신호에 특이적인 반응을 하도록 전환하는 일련의 물질 변화이다.<br /><br /><br />초파리에서 호메오 유전자들을 연구하던 과학자들은 그들이 연구하던 모든 호메오 유전자에서 180핵산체로 이루어진 염기서열이 공통적으로 존재하고 있다는 사실을 발견하였다. 그 후 매우 유사한 염기서열들이 효모, 식물, 지러이, 개구리, 닭, 쥐, 사람을 포함하여 지금까지 연구된 거의 모든 진핵생물에서 발견되었다. 이들 염기서열을 호메오박스(homeobox)라하며 이것은 호메오 유전자의 단백질 내에 60개의 아미노산으로 이루어진 작은 부분을 이루고 있다. 호메오박스의 폴리펩티드 부분은 특정의 DNA 염기서열과 결합하여 호메오 단백질이 발달 중에 있는 유전자 집단을 켜거나 끌 수 있다.</font></p>