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TIGR Gene Indices

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TIGR Gene Indices

EST cDNA 라이브러리를 UniGene에 초점을 맞추고 토의하는 동안, 다른 중요한 재료들도 유효하다. Genomic Research 협회는 TIGR Gene Indices를 제공하고, EST의 수집은 체계화되어서 몇몇 다스의 종-특이적 데이터베이스에 들어간다(Quackenbush et.al., 2001; Lee et.al., 2002). TIGR에 접근은 tentative consensus(TC) 서열로 불리우는 유일한 Gene을 조합하기 위해 EST 서열 분석에 초점이 맞추어 진다. TIGR Gene Indices UniGene의 즉시 이용 가능한 것은 아니고 다양한 목적에 유용하다. TIGR 진핵 유전자 존재론 (EGO) 데이터베이스는 TC 서열의 쌍 정렬에 의해 othologous 유전자의 동일시에 의하거나, 일치하는 유전자의 수많은 장기 비교에 의해 이루어진다. TIGR Gene Indices는 또한 blastn tblastn에 의해 접근되어진다. (Table 5.1 and Figs. 5.3-5.5)

             EST는 전체-길이 복제의 일반적 방법에 연관되어진다. The Interated Molecular Analysis of Genomes and Their Expression (IMAGE) 연합은 라이브러리와 분류에 유용하게 만들어 수집되어진다. The Mammalian Gene Collection (MGC)는 또한 전체-길이의 인간과 쥐 복제물을 제공하는 NIH 프로젝트이다. 이것은 (Fig. 6.8) 블라스트에서 찾을수 있다.