핵산과 단백질이 결합한 물질. 핵산 가운데는 단백질과 결합하지 않고 유리 상태로 존재하는 것도 있으나, 많은 핵산이 단백질과 결합되어 세포 내에 존재하고 있다. 박테리아의 핵산 가운데 DNA는 단백질과 결합하지 않은 것 같으나, 동식물의 DNA는 히스톤 또는 프로타민이라는 염기성 단백질과 단단히 결합되어 염색체를 이루고 있다. 또 RNA 가운데 리보솜RNA 즉 rRNA도 세포질 속에서 단백질과 결합한다. 핵산과 단백질 사이의 결합 양식에 대해서는 아직도 분명하지 않은 부분이 많으나, 핵산이 산성이고 단백질은 대체로 염기성인 것으로 보아 양자간의 정전인력(靜電引力)에 의한 것이라고 생각되고 있다. 그러나 전형적인 이온결합은 아니다. 핵단백질에서 단백질의 역할에 대해서는 아직도 충분히 밝혀져 있지 않으나 핵산의 기능을 어떤 방식으로 조절통제하는 것이 아닌가 추측된다.