기본적으로 Southern blot의 기술과 같으며 이것은 DAN- RNA 접합을 이용한 것이다.
이과정에서 유의해야 할 점은 RNA는 DNA와 다르게 RNase에 의해 분해되기가 쉽다는 것이다. RNase는 상당히 안정한 효소이기 때문에 쉽게 활성을 잃지 않는다. 따라서 시약이나 기구를 사용할때에는 RNase - free라 쓰여있는 것을 사용해야 한다. RNase는 사람손등에 매우 많기 때문에 조심해야한다. RNase는 박테리아, 바이러스들의 칩입을 막는 방어용으로 동물이 분비를 많이한다.