미생물에 관해 연구하는 생물학의 한 분야.
미생물은 넓은 뜻으로 해석하는 것에서부터 좁은 뜻으로 해석하는 것까지 여러 가지이다. 미생물학의 역사적인 발전과정은 먼저 의학이나 농학 등 인간에게 밀접한 관계를 갖는 연구로부터 출발하여 기초분야의 연구로 옮겨져 이학적인 연구가 행해진 뒤, 응용영역으로 환원하는 독특한 경로를 거쳤다. 미생물학은 넓은 의미로는 바이러스학·세균학·균류학·원생동물학 등의 광범위한 학문분야를 포함하고, 그 각각에 분류학·형태학·세포학·생태학·유전학 및 생리학·생화학의 영역을 포함하고 있다. 미생물학은 기초미생물학·응용미생물학 등으로 구분되기도 한다. 응용미생물학은 인간의 생활에 소용되는 미생물을 대상으로 하는 과학으로서 발효미생물학, 식용·약용미생물학 등이 있다. 병원미생물학은 인간이나 다른 동물에 병원성을 갖는 미생물을 대상으로 하며, 이 가운데는 인수감염미생물학, 세균성 식중독의 과학을 중심으로 한 위생미생물학, 전염병학 등이 있으며 모두 인간과 밀접한 관계가 있다. 식물병원미생물학은 농작물, 과수나 수목의 병리학을 중심으로 한 과학이다. 최근에는 토양미생물학 및 해양미생물학 등이 주목받고 있다.