Motif vs Domain
Domain
도메인은 삼차구조로 이루어져 있으며 공 모양 또는 섬유 모양 부분으로 구분된다. 구조적으로 도메인(domain)은 폴리펩타이드(polypeptide)가 뭉쳐서 만들어진 큰 단백질의 경우에 x-ray나 전자현미경으로 관찰이 가능하다. 예를 들어 hemagglutinin은 공 모양의 도메인과 섬유 모양의 도메인으로 구성되어져 있다.
도메인은 100-200개의 잔기로 이루어져 있으며, α helix, β sheet, turn, random coil의 구조가 다양하게 조합되어있고, 때로는 특이한 구조의 도메인을 이루기도 하며 특정 아미노산이 모인 proline-rich domain등이 있다.
때로는 기능적인 부분을 일컬을때 사용하기도 한다. 예를 들어 kinase domain 과 같이 단백질에서 효소의 촉매 작용을 일으키는 부분을 나타내기도 하고, DNA-binding domain이나 membrane-binding domain과 같이 하나의 단백질내에서 DNA나 생체막과 결합하는 부위를 가르키기도 한다. 이런 기능적인 도메인은 주로 실험을 통해 밝혀지며, 적어도 하나 또는 여러개의 구조적 도메인으로 구성되어 있다.