Archaea 안의 lipids는 화학적으로 독특하다.
Bacteria 와 Eukarya 안의 lipids는 glycerol molecule의 fatty acids인 ester linkages bond 이다. 하지만 Archaea의 lipids는 glycerol과 hydrophobic side chains 사이의 ether likage이다.
게다가 Archaea의 lipids는 fatty acids 가 부족한 대신에 5탄당 탄화수소(five-caebon hydrocarbon) isoprene의 unit들이 반복되어 있는 side chains을 가지고 있다.
그러나 Archaea의 전반적 구조는 안과 외부가 친수성인 표면과 소수성인 내부를 형성하고 있는 lipid membranes로 구성 되어 있다. Glycerol diethers와 glycerol tetraethers는 Archaea안에 존재하고 있는 주요 lipids의 구성성분이다.
각각의 glycerol molecule로부터 온 tetraether molecules인 phytanyl(isoprenes 4개로 구성)의 side chains이 서로 공유결합(covalent bond)을 하고 있다.
membrane structure 내에서는 lipid bilayer대신에 lipid monolayer를 더 많이 구성하고 있다.
lipid monolayers는 lipid bilayers에 비해서 더 견고하기 때문에 이 membrane structure가 hyperthermophilic Archaea(매우 높은 온도에서 자랄 수 있는 prokaryotes) 의 membrane structure로 구성된다는 것은 그다지 놀라운 일이 아니다.