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SAGE

Revision as of 20:14, 18 May 2006 by Ksjung (talk | contribs)
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Serial Analysis of Gene Expression (SAGE)


'유전자 발현 직렬분석(Serial Analysis of Gene Expression)'은 정량적이고도 고속처리가 가능한
유전자 발현 분석 실험방법이다(Velculescu, 1995). SAGE는 각 전사체 내 특정 위치로부터 고유한
단편 서열표지(Sequence tag)를 분리한다. 이 서열 표지들을 서로 잇고 클로닝한 후 염기 서열을 
결정한다. 초기 세포군 내 특정 전사체의 빈도는 서열군 내에서 발견되는 해당 서열 표지의 빈도로서
나타난다. SAGEmap 데이터베이스는 SAGE 데이터 중 일부를 축적해 놓은 것이며 유전자 발현 분석을
위한 도구들 또한 SAGEmap 웹사이트에서 이용 가능하다. 가상 노던(virtual northern)은 이용자가
제공하는 mRNA 서열내의 SAGE 표지를 예측해내고 SAGE 라이브러리 내에서 그 표지의 분포를 
계산 함으로써 그 mRNA의 발현 양상에 대한 가상적 도표를 그려낸다. SAGE xProfiler에서는
'대장암 대 정상대장'과 같은 두 개의 라이브러리군을 선택해야 한다. 이 도구는 어는 SAGE 표지가
어느 라이브러리군에 더 많이 존재하는지를 계산한다. 결과에 대한 생물학적 정보를 제공하기 위하여
SAGE 표지의 지도 위치가 유니진 클러스터에 작성되어 있다.