C-F법

C-F법

C-F method : 아미노산의 2차구조를 예측하는데 사용되는 method이다. 
- 1974년과 1978년에 챠오와 파스만에 의해여 제한되어졌다.
- 2차 구조 형성에 필요한 개별 아미노산의 확률적 발생빈도에 근거를 두고 분석하고 있다.
- 우선 2차 구조를 이루는 a-helix과 b-sheet, loop, turn 구조에 해당하는 개별적인 아미노산의 확률적 발생 빈도를 구하고
   각각의 2차 구조체 형성과 규칙성을 연결하여 2차 구조를 결정한다.
- 예측도는 약 50~55% 정도를 나타낸다.

#구조예측의 원리
1. a-helix, b-sheet 구조를 이루는 각 아미노산의 발생빈도를 분석후 가중치를 도표로작성
2. 주어진 서열에 존재하는 아미노산들을 분석후 a-helix, b-sheet 가능성을 판별하여 양쪽으로 확장해나감
3. a-helix, b-sheet 구조가 겹칠 경우 할당된 블록 안의 P(나선)와 P(평판) 두값의 평균치를 구하여 최고 점수치에 할당함
4. turn 구조의 경우에 순차하는 4개의 아미노산을 중심으로 2단계 개별 확률 치로 수치화