Motif Searching

MOTIF Searching

BLAST2에는 protein seq의 특정 패턴을 검색할수있는 Phi-BLAST가 있다. Phi-BLAST는 입력으로 protein auery seq와 
seq에 포함된 패턴을 찾아주고 집정된 데이터베이스에서 입력으로 주어진 input 패턴을 포함해서 patten 발생지점 
근처에서 signigicant simility를 가진 단백질 서열도 검색한다.
Phi BLAST와 Psi-BLAST가 통합되면서 Phi-BLAST query의 결과를 가지는 Psi-BLAST searching를 개시할수 있었다. 
Phi-BLAST는 현재도 개발중이거나 시간이 지남에 따라 기본적인 내용으로 바꿀수 있다.