막단백질 분류 (membrane protein classification)

JS Singer가 제안한 막단백질 분류 (membrane protein classification)

1. TypeⅠ
  - have a single transmembrane stretch of hydrophobic residue.
  - NH2 말단이 transmembrane domain의 바깥쪽에 위치
  - COOH 말단이 transmembrane domain의 안쪽에 위치 (세포질 상으로 위치)
     ① TypeⅠa (cleavable signal sequence를 가짐)
     ② TypeⅠb (cleavable signal sequence를 가지고 있지 않음)
   * 대부분의 single spanning region을 갖는 진핵생물의 막단백질은 TypeⅠa이다.

2. TypeⅡ
   - TypeⅠ class와 막을 오직 한 번 spanning하고 있다는 점에서는 유사하지만 NH2 말단이 세포질 상으로 뻗어 있고, COOH 말단이 막 바깥쪽으로 위치한다.

3. TypeⅢ
   - 하나의 poly-peptide chain안에 여러 개의 transmembrane domain을 가진다. 
     ① TypeⅢa: cleavable signal sequence를 가지고, photoreaction center의 M&L peptide들을 포함한다.
     ② TypeⅢb: NH2 말단이 막 바깥쪽으로 향하나 cleavable signal sequence를 가지고 있지 않다.
                         예) cytochrome p450, E.coli의 leader peptidase