Difference between revisions of "BLAT"
From Opengenome.net
| Line 1: | Line 1: | ||
| − | <font size="2">BLAT은 DNA나 단백질 서열들을 [[BLAST]]와 같은 기존의 프로그램보다 더 빠른 속도로 pair-wised [[alignment]]를 <br />하는 프로그램으로, Genome browser를 개발한 University of California, Santa Cruz에서 <font color="#ff6600">대량의 DNA나 단백질</font> <br />서열 데이터를 [[ | + | <font size="2">BLAT은 DNA나 단백질 서열들을 [[BLAST]]와 같은 기존의 프로그램보다 더 빠른 속도로 pair-wised [[alignment]]를 <br />하는 프로그램으로, Genome browser를 개발한 University of California, Santa Cruz에서 <font color="#ff6600">대량의 DNA나 단백질</font> <br />서열 데이터를 [[Genome]]<font color="#ff6600">에 [[mapping]] 시키기 위해서 개발된 프로그램</font>이다. <br />특히, [[BLAST]]나 [[FASTA]]와 같은 다른 local alignment program들과는 달리 일치된 서열 조각들을 하나의 <br />긴 [[global alignment]]로 보여줌으로써 genome상에서 [[intron]]과 [[exon]]부분을 위치를 알 수 있게 해준다.<br /></font><br /><br /> |
Latest revision as of 17:17, 18 May 2006
BLAT은 DNA나 단백질 서열들을 BLAST와 같은 기존의 프로그램보다 더 빠른 속도로 pair-wised alignment를
하는 프로그램으로, Genome browser를 개발한 University of California, Santa Cruz에서 대량의 DNA나 단백질
서열 데이터를 Genome에 mapping 시키기 위해서 개발된 프로그램이다.
특히, BLAST나 FASTA와 같은 다른 local alignment program들과는 달리 일치된 서열 조각들을 하나의
긴 global alignment로 보여줌으로써 genome상에서 intron과 exon부분을 위치를 알 수 있게 해준다.
