Difference between revisions of "BLAT"

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<font size="2">BLAT은 DNA나 단백질 서열들을 [[BLAST]]와 같은 기존의 프로그램보다 더 빠른 속도로 pair-wised [[alignment]]를&nbsp;<br />하는 프로그램으로, Genome browser를 개발한 University of California, Santa Cruz에서 <font color="#ff6600">대량의 DNA나 단백질</font>&nbsp;<br />서열 데이터를 [[<font color="#ff6600">Genome]]에 [[mapping]] 시키기 위해서 개발된 프로그램</font>이다. <br />특히, [[BLAST]]나 [[FASTA]]와 같은 다른 local alignment program들과는 달리 일치된 서열 조각들을 하나의&nbsp;<br />긴 [[global alignment]]로 보여줌으로써 genome상에서 [[intron]]과 [[exon]]부분을 위치를 알 수 있게 해준다.<br /></font><br /><br />
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<font size="2">BLAT은 DNA나 단백질 서열들을 [[BLAST]]와 같은 기존의 프로그램보다 더 빠른 속도로 pair-wised [[alignment]]를&nbsp;<br />하는 프로그램으로, Genome browser를 개발한 University of California, Santa Cruz에서 <font color="#ff6600">대량의 DNA나 단백질</font>&nbsp;<br />서열 데이터를 [[<font color="#ff6600">Genome<font color="#000000">]]</font><font color="#000000">[[</font>mapping<font color="#000000">]]</font> 시키기 위해서 개발된 프로그램</font>이다. <br />특히, [[BLAST]]나 [[FASTA]]와 같은 다른 local alignment program들과는 달리 일치된 서열 조각들을 하나의&nbsp;<br />긴 [[global alignment]]로 보여줌으로써 genome상에서 [[intron]]과 [[exon]]부분을 위치를 알 수 있게 해준다.<br /></font><br /><br />

Revision as of 17:17, 18 May 2006

BLAT은 DNA나 단백질 서열들을 BLAST와 같은 기존의 프로그램보다 더 빠른 속도로 pair-wised alignment를 
하는 프로그램으로, Genome browser를 개발한 University of California, Santa Cruz에서 대량의 DNA나 단백질 
서열 데이터를 [[Genome]][[mapping]] 시키기 위해서 개발된 프로그램이다.
특히, BLASTFASTA와 같은 다른 local alignment program들과는 달리 일치된 서열 조각들을 하나의 
global alignment로 보여줌으로써 genome상에서 intronexon부분을 위치를 알 수 있게 해준다.