Difference between revisions of "Smith-Waterman Algorithm"

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Smith-Waterman Algorithm

Smith-Waterman AlgorithmÃÂ¬ÃÂÃÂ Dynamic ProgrammingÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂ¼ÃÂ«ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ°ÃÂÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂªÃÂ³ÃÂ ÃÂ«ÃÂ¦ÃÂ¬ÃÂ¬ÃÂ¦ÃÂ ÃÂ¬ÃÂ¤ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂÃÂÃÂÃÂ«ÃÂÃÂÃÂ«ÃÂ¡ÃÂ ÃÂªÃÂ°ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ¥ ÃÂªÃÂ°ÃÂÃÂ«ÃÂÃÂ¨ÃÂÃÂÃÂ ÃÂÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂµÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂªÃÂ³ÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂªÃÂ³ÃÂ , ÃÂªÃÂ·ÃÂ¸ ÃÂÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂµÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ¬ÃÂÃÂ©ÃÂÃÂÃÂ´ ÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂ¬ÃÂ ÃÂ
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 <p><font color="#800080" size="3"><strong>Smith-Waterman Algorithm</strong></font></p>
-<p>Smith-Waterman AlgorithmÃ¬ÂÂ Dynamic ProgrammingÃ¬ÂÂ´Ã«ÂÂ¼Ã«ÂÂ Ã¬Â ÂÃ¬ÂÂ°ÃÂÂÃ¬ÂÂ Ã¬ÂÂÃªÂ³Â Ã«Â¦Â¬Ã¬Â¦Â Ã¬Â¤ÂÃ¬ÂÂ ÃÂÂÃ«ÂÂÃ«Â¡Â ÃªÂ°ÂÃ¬ÂÂ¥ ÃªÂ°ÂÃ«ÂÂ¨ÃÂÂ ÃÂÂ´Ã«ÂÂµÃ¬ÂÂ Ã¬ÂÂÃªÂ³Â Ã¬ÂÂÃªÂ³Â , ÃªÂ·Â¸ ÃÂÂ´Ã«ÂÂµÃ¬ÂÂ Ã¬ÂÂ´Ã¬ÂÂ©ÃÂÂ´ Ã¬Â ÂÃ¬Â Â&nbsp;<br />Ã«ÂÂ ÃÂÂ° Ã«Â²ÂÃ¬ÂÂÃ«Â¡Â ÃÂÂÃ¬ÂÂ¥ Ã¬ÂÂÃ¬Â¼ÂÃ«ÂÂÃªÂ°ÂÃ«Â©Â´Ã¬ÂÂ Ã«Â§ÂÃ¬Â§ÂÃ«Â§Â ÃÂÂ´Ã«ÂÂµÃ¬ÂÂ Ã¬ÂÂ»Ã«ÂÂ ÃªÂ²Â½Ã¬ÂÂ°Ã¬ÂÂ Ã¬ÂÂ¬Ã¬ÂÂ©Ã«ÂÂÃ«ÂÂ Ã¬ÂÂÃªÂ³Â Ã«Â¦Â¬Ã¬Â¦ÂÃ¬ÂÂ´Ã«ÂÂ¤. ÃªÂ°ÂÃ¬ÂÂ¥ ÃªÂ°ÂÃ«ÂÂ¨ÃÂÂ t(ÃÂÂ)ÃªÂ³Â¼ s(Ã¬ÂÂ´)Ã¬ÂÂ Ã¬Â²Â«Ã«Â²ÂÃ¬Â§Â¸ Ã¬ÂÂÃ¬ÂÂ´Ã¬ÂÂ Ã¬Â ÂÃ¬Â ÂÃÂÂ Ã«Â°Â°Ã¬ÂÂ´Ã¬ÂÂ Ã«ÂÂÃÂÂ&nbsp;<br />ÃÂÂ´Ã«ÂÂµÃ¬ÂÂ Ã¬ÂÂ½ÃªÂ²Â Ã¬ÂÂ»Ã¬ÂÂÃ¬ÂÂ Ã¬ÂÂÃªÂ³Â , ÃªÂ·Â¸ ÃªÂ°ÂÃ¬ÂÂ ÃªÂ·Â¼ÃªÂ±Â°Ã«Â¡Â ÃÂÂÃ¬ÂÂ¬ ÃÂÂ´Ã«ÂÂµÃ¬ÂÂ Ã¬Â ÂÃ¬Â Â ÃÂÂÃ¬ÂÂ¥ Ã¬ÂÂÃ¬Â¼Â Ã¬Â ÂÃ¬Â²Â´ Ã¬ÂÂÃ¬ÂÂ´Ã¬ÂÂ Ã¬Â ÂÃ¬Â ÂÃÂÂ Ã«Â°Â°Ã¬ÂÂ´Ã«Â¡Â ÃªÂµÂ¬ÃÂÂÃÂÂÃ«ÂÂ ÃªÂ²ÂÃ¬ÂÂ´Ã«ÂÂ¤.<br /><a href="http://biocc.ngic.re.kr/Biopedia/Biowiki/images/c/cb/Smith.gif">http://biocc.ngic.re.kr/Biopedia/Biowiki/images/c/cb/Smith.gif</a><br />&nbsp;<br /># Ã¬Â°Â¸ÃªÂ³Â  Ã¬ÂÂ¬Ã¬ÂÂ´ÃÂÂ¸<br /><a href="http://www.maths.tcd.ie/~lily/pres2/sld009.htm">http://www.maths.tcd.ie/~lily/pres2/sld009.htm</a><br /></p>
+<p>Smith-Waterman AlgorithmÃÂ¬ÃÂÃÂ Dynamic ProgrammingÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂ¼ÃÂ«ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ°ÃÂÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂªÃÂ³ÃÂ ÃÂ«ÃÂ¦ÃÂ¬ÃÂ¬ÃÂ¦ÃÂ ÃÂ¬ÃÂ¤ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂÃÂÃÂÃÂ«ÃÂÃÂÃÂ«ÃÂ¡ÃÂ ÃÂªÃÂ°ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ¥ ÃÂªÃÂ°ÃÂÃÂ«ÃÂÃÂ¨ÃÂÃÂÃÂ ÃÂÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂµÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂªÃÂ³ÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂªÃÂ³ÃÂ , ÃÂªÃÂ·ÃÂ¸ ÃÂÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂµÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ¬ÃÂÃÂ©ÃÂÃÂÃÂ´ ÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂ¬ÃÂ ÃÂ&nbsp;<br />ÃÂ«ÃÂÃÂ ÃÂÃÂÃÂ° ÃÂ«ÃÂ²ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂ«ÃÂ¡ÃÂ ÃÂÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ¥ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂ¼ÃÂÃÂ«ÃÂÃÂÃÂªÃÂ°ÃÂÃÂ«ÃÂ©ÃÂ´ÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ«ÃÂ§ÃÂÃÂ¬ÃÂ§ÃÂÃÂ«ÃÂ§ÃÂ ÃÂÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂµÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂ»ÃÂ«ÃÂÃÂ ÃÂªÃÂ²ÃÂ½ÃÂ¬ÃÂÃÂ°ÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂ¬ÃÂ¬ÃÂÃÂ©ÃÂ«ÃÂÃÂÃÂ«ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂªÃÂ³ÃÂ ÃÂ«ÃÂ¦ÃÂ¬ÃÂ¬ÃÂ¦ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂ¤. ÃÂªÃÂ°ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ¥ ÃÂªÃÂ°ÃÂÃÂ«ÃÂÃÂ¨ÃÂÃÂÃÂ t(ÃÂÃÂÃÂ)ÃÂªÃÂ³ÃÂ¼ s(ÃÂ¬ÃÂÃÂ´)ÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂ²ÃÂ«ÃÂ«ÃÂ²ÃÂÃÂ¬ÃÂ§ÃÂ¸ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂÃÂÃÂ ÃÂ«ÃÂ°ÃÂ°ÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ«ÃÂÃÂÃÂÃÂÃÂ&nbsp;<br />ÃÂÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂµÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂ½ÃÂªÃÂ²ÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂ»ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂªÃÂ³ÃÂ , ÃÂªÃÂ·ÃÂ¸ ÃÂªÃÂ°ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂªÃÂ·ÃÂ¼ÃÂªÃÂ±ÃÂ°ÃÂ«ÃÂ¡ÃÂ ÃÂÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ¬ ÃÂÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂµÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂ¬ÃÂ ÃÂ ÃÂÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ¥ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂ¼ÃÂ ÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂ¬ÃÂ²ÃÂ´ ÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ¬ÃÂÃÂ ÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂ¬ÃÂ ÃÂÃÂÃÂÃÂ ÃÂ«ÃÂ°ÃÂ°ÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂ¡ÃÂ ÃÂªÃÂµÃÂ¬ÃÂÃÂÃÂÃÂÃÂÃÂÃÂ«ÃÂÃÂ ÃÂªÃÂ²ÃÂÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂ«ÃÂÃÂ¤.<br /><a href="http://biocc.ngic.re.kr/Biopedia/Biowiki/images/c/cb/Smith.gif">http://biocc.ngic.re.kr/Biopedia/Biowiki/images/c/cb/Smith.gif</a><br />&nbsp;<br /># ÃÂ¬ÃÂ°ÃÂ¸ÃÂªÃÂ³ÃÂ  ÃÂ¬ÃÂÃÂ¬ÃÂ¬ÃÂÃÂ´ÃÂÃÂÃÂ¸<br /><a href="http://www.maths.tcd.ie/~lily/pres2/sld009.htm">http://www.maths.tcd.ie/~lily/pres2/sld009.htm</a><br /></p>

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