Difference between revisions of "DNA structure"
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<p>1. DNA structure : The double helix<br /><br />네 가지의 nucleic acid bases를 DNA에서 찾아 볼 수 있다. 그 네 가지로는 adenine(A), guanine(G), cytosine(C), 그리고 thymine(T) 이렇게 네 가지 이다. 이 중 adenine과 guanine은 purine이라고 하고, cytosine 과 thymine은 pyrimidine이라고 한다. 인산과 5탄당의 [[deoxyribose]]의 반복으로 연결된 DNA chain의 backbone을 구성하고 있는 이들은 각각 하나의 base를 가지고 연결되어 있다. 인산은 하나의 당의 3'-carbon과 다른 또 하나의 당의 5'-carbon을 연결하는 역할을 한다. 당에서 DNA molecule의 한 쪽 끝은 5'-수산화 기에 인산을 가지고 있고, 이와 대조적으로 다른 한 쪽 끝의 당에는 3'-위치에 자유스러운 수산화기가 달려 있다. 이 곳을 다른 당의 인산이 공격해서 base backbone을 구성해 나간다.<br /><br />-DNA as a double helix<br /><br />DNA의 2차 구조는 실제로 protein의 2차 구조와 아주 유사하다. 수소 결합에 의해서 결합된 protein 단 하나의 α-helix 구조는 엑스레이 회절 학문의 원조로 발견되었다. DNA를 위한 엑스레이 에돌이 무늬는 약간 유사한 bone을 보여준다. 게다가, E.Chargaff에 의하여 화학 학문은 DNA의 구조에 관하여 몇 가지 중요한 실마리를 나타낸다. 모든 유기체의 DNA에서 adenine과 thymine의 농도가 동등하게 나타낸다는 것과, guanine과 cytosine의 농도가 동등하게 나타낸 다는 것이 그 것이다. <br />거의 같은 축선인 두 개의 오른쪽으로 회전하는 polynucleotide 사슬이 DNA에 있는 이중 나사선에 의하여 이루어져 있다. 이종 환식 amine은 중앙에서 1개의 물가의 기초가 다른 물가의 기초와 서로 상호 작용하거나, 한 쌍이 되어서 project 내부의 기초를 둔다. 화학제품 및 엑스레이 자료 및 모델 구성 운동에 따르면, 특정한 이종 환식 amine 기초만 한 쌍이 될 지도 모른다. 기초적으로 한 쌍이 되는 것은 heterocylic amine 사이 수소 결합의 대형에 있는 특정한 기하학 필요조건이 있기 때문에 무료한 이라 칭한다. 이종 환식 amine의 기본적인 한 쌍이 되는 것은 수소 접합 원리의 신청이다. 이종 환식 amine 기본 접합에 의한 구조에서는, thymine과 adenine의 두 개의 수소 결합과, guanine과 cytosine의 세 개의 수소 결합을 통한 상호 작용에 의해서 이루어 진다. 다른 기본적인 한 쌍이 되 수소 접합 조합이 가능할 지도 모른다. 결합 길이가 이미 인용되기 이전의 기본적인 쌍에 의해 주어지기 때문에 그들에 대응하지 않기 위해서 이용되지 않는다. DNA를 구상하는 쉬운 방법은 타래 송곳 모양으로 뒤틀린 광대하게 긴 밧줄 사다리라고 할 수 있다. 사다리의 측은 사다리 (기초)의 가로대가 확고한 사다리의 측에 붙어 있는 각 부속을 가진 2개 부품에서 하는 동안 deoxyribose와 인산염(backbone)의 순서를 교체하고 있다. 가로대에 있는 부분은 수소 접합에 의해 적소에 놓여있는 이종 환식 amine이다. 최대 DNA가 전면적인 이중 나사선으로 존재하더라도, 약간의 세균성 DNA는 주기적인 나선으로 존재한다. 때때로 DNA는 또한 단일 나선으로 존재하기도 한다. 이러한 나선형 구조에 의해서 DNA에는 움푹 페인 곳이 존재하게 되는데, 깊게 페인 부분을 major groove라고 하고, 좀 더 얕게 페인 부분을 minor groove라고 한다. 이들은 protein과 상호 작용을 하는 부분으로써 중요한 역할을 한다. 또한, DNA는 두 개의 [[antiparalle]]한 polypeptide 형태로 서로 마주보고 나선 구조를 형성하고 있다.<br /><br />-Size of a DNA molecule</p> | <p>1. DNA structure : The double helix<br /><br />네 가지의 nucleic acid bases를 DNA에서 찾아 볼 수 있다. 그 네 가지로는 adenine(A), guanine(G), cytosine(C), 그리고 thymine(T) 이렇게 네 가지 이다. 이 중 adenine과 guanine은 purine이라고 하고, cytosine 과 thymine은 pyrimidine이라고 한다. 인산과 5탄당의 [[deoxyribose]]의 반복으로 연결된 DNA chain의 backbone을 구성하고 있는 이들은 각각 하나의 base를 가지고 연결되어 있다. 인산은 하나의 당의 3'-carbon과 다른 또 하나의 당의 5'-carbon을 연결하는 역할을 한다. 당에서 DNA molecule의 한 쪽 끝은 5'-수산화 기에 인산을 가지고 있고, 이와 대조적으로 다른 한 쪽 끝의 당에는 3'-위치에 자유스러운 수산화기가 달려 있다. 이 곳을 다른 당의 인산이 공격해서 base backbone을 구성해 나간다.<br /><br />-DNA as a double helix<br /><br />DNA의 2차 구조는 실제로 protein의 2차 구조와 아주 유사하다. 수소 결합에 의해서 결합된 protein 단 하나의 α-helix 구조는 엑스레이 회절 학문의 원조로 발견되었다. DNA를 위한 엑스레이 에돌이 무늬는 약간 유사한 bone을 보여준다. 게다가, E.Chargaff에 의하여 화학 학문은 DNA의 구조에 관하여 몇 가지 중요한 실마리를 나타낸다. 모든 유기체의 DNA에서 adenine과 thymine의 농도가 동등하게 나타낸다는 것과, guanine과 cytosine의 농도가 동등하게 나타낸 다는 것이 그 것이다. <br />거의 같은 축선인 두 개의 오른쪽으로 회전하는 polynucleotide 사슬이 DNA에 있는 이중 나사선에 의하여 이루어져 있다. 이종 환식 amine은 중앙에서 1개의 물가의 기초가 다른 물가의 기초와 서로 상호 작용하거나, 한 쌍이 되어서 project 내부의 기초를 둔다. 화학제품 및 엑스레이 자료 및 모델 구성 운동에 따르면, 특정한 이종 환식 amine 기초만 한 쌍이 될 지도 모른다. 기초적으로 한 쌍이 되는 것은 heterocylic amine 사이 수소 결합의 대형에 있는 특정한 기하학 필요조건이 있기 때문에 무료한 이라 칭한다. 이종 환식 amine의 기본적인 한 쌍이 되는 것은 수소 접합 원리의 신청이다. 이종 환식 amine 기본 접합에 의한 구조에서는, thymine과 adenine의 두 개의 수소 결합과, guanine과 cytosine의 세 개의 수소 결합을 통한 상호 작용에 의해서 이루어 진다. 다른 기본적인 한 쌍이 되 수소 접합 조합이 가능할 지도 모른다. 결합 길이가 이미 인용되기 이전의 기본적인 쌍에 의해 주어지기 때문에 그들에 대응하지 않기 위해서 이용되지 않는다. DNA를 구상하는 쉬운 방법은 타래 송곳 모양으로 뒤틀린 광대하게 긴 밧줄 사다리라고 할 수 있다. 사다리의 측은 사다리 (기초)의 가로대가 확고한 사다리의 측에 붙어 있는 각 부속을 가진 2개 부품에서 하는 동안 deoxyribose와 인산염(backbone)의 순서를 교체하고 있다. 가로대에 있는 부분은 수소 접합에 의해 적소에 놓여있는 이종 환식 amine이다. 최대 DNA가 전면적인 이중 나사선으로 존재하더라도, 약간의 세균성 DNA는 주기적인 나선으로 존재한다. 때때로 DNA는 또한 단일 나선으로 존재하기도 한다. 이러한 나선형 구조에 의해서 DNA에는 움푹 페인 곳이 존재하게 되는데, 깊게 페인 부분을 major groove라고 하고, 좀 더 얕게 페인 부분을 minor groove라고 한다. 이들은 protein과 상호 작용을 하는 부분으로써 중요한 역할을 한다. 또한, DNA는 두 개의 [[antiparalle]]한 polypeptide 형태로 서로 마주보고 나선 구조를 형성하고 있다.<br /><br />-Size of a DNA molecule</p> | ||
| − | <p>DNA | + | <p>DNA molecule의 크기는 nucleotide bases의 수천개의 개수의 간격이나 또는 몇 개의 molecule의 base pairs의 간격에 의해서 결정이 된다. 그러므로, 1000개의 base로 구성되어 있는 DNA molecules를 DNA의 1kilobase(kb)라고 할 수 있는 것이다. 만약 DNA가 double helix라면, 하나로 구성된 것 보다는 kilobase pairs(kbp)라고 불리는 것이 더 잘 맞을 것이다. 그러므로, double helix 5000 base pairs의 크기는 5kbp라고 부를 수 있다. 박테리아의 한 종류인 Escherichia coli는 그들의 chromosome에 4640 쌍의 DNA를 가지고 잇다. 이러한 거대한 양의 유전적 sequence정보가 현재 주어진 상태에서, 이것은 종종 base pairs의 수백만개의 언어로 사용될 수 있거나, 또는 이를 megabase pairs(mbp)라고 이야기 한다. E.coli의 유전자는 4.64Mbp이다.<br />실제적인 길이의 차이는, 각각의 base pair는 helix 상에서 0.34nm 정도의 차이를 나타낸다. 그리고, 각각의 helix의 turn은 10개의 base pairs 마다 하나씩 나타나고 있다. 그러므로, DNA의 1 kilobase는 helix의 100개의 turn과 같고, 이것의 길이는 0.34μm와 같다. <br /><br />-Inverted repeats, secondary structure, and stem-loop<br /><br /></p> |
Revision as of 18:16, 9 July 2006
1. DNA structure : The double helix
네 가지의 nucleic acid bases를 DNA에서 찾아 볼 수 있다. 그 네 가지로는 adenine(A), guanine(G), cytosine(C), 그리고 thymine(T) 이렇게 네 가지 이다. 이 중 adenine과 guanine은 purine이라고 하고, cytosine 과 thymine은 pyrimidine이라고 한다. 인산과 5탄당의 deoxyribose의 반복으로 연결된 DNA chain의 backbone을 구성하고 있는 이들은 각각 하나의 base를 가지고 연결되어 있다. 인산은 하나의 당의 3'-carbon과 다른 또 하나의 당의 5'-carbon을 연결하는 역할을 한다. 당에서 DNA molecule의 한 쪽 끝은 5'-수산화 기에 인산을 가지고 있고, 이와 대조적으로 다른 한 쪽 끝의 당에는 3'-위치에 자유스러운 수산화기가 달려 있다. 이 곳을 다른 당의 인산이 공격해서 base backbone을 구성해 나간다.
-DNA as a double helix
DNA의 2차 구조는 실제로 protein의 2차 구조와 아주 유사하다. 수소 결합에 의해서 결합된 protein 단 하나의 α-helix 구조는 엑스레이 회절 학문의 원조로 발견되었다. DNA를 위한 엑스레이 에돌이 무늬는 약간 유사한 bone을 보여준다. 게다가, E.Chargaff에 의하여 화학 학문은 DNA의 구조에 관하여 몇 가지 중요한 실마리를 나타낸다. 모든 유기체의 DNA에서 adenine과 thymine의 농도가 동등하게 나타낸다는 것과, guanine과 cytosine의 농도가 동등하게 나타낸 다는 것이 그 것이다.
거의 같은 축선인 두 개의 오른쪽으로 회전하는 polynucleotide 사슬이 DNA에 있는 이중 나사선에 의하여 이루어져 있다. 이종 환식 amine은 중앙에서 1개의 물가의 기초가 다른 물가의 기초와 서로 상호 작용하거나, 한 쌍이 되어서 project 내부의 기초를 둔다. 화학제품 및 엑스레이 자료 및 모델 구성 운동에 따르면, 특정한 이종 환식 amine 기초만 한 쌍이 될 지도 모른다. 기초적으로 한 쌍이 되는 것은 heterocylic amine 사이 수소 결합의 대형에 있는 특정한 기하학 필요조건이 있기 때문에 무료한 이라 칭한다. 이종 환식 amine의 기본적인 한 쌍이 되는 것은 수소 접합 원리의 신청이다. 이종 환식 amine 기본 접합에 의한 구조에서는, thymine과 adenine의 두 개의 수소 결합과, guanine과 cytosine의 세 개의 수소 결합을 통한 상호 작용에 의해서 이루어 진다. 다른 기본적인 한 쌍이 되 수소 접합 조합이 가능할 지도 모른다. 결합 길이가 이미 인용되기 이전의 기본적인 쌍에 의해 주어지기 때문에 그들에 대응하지 않기 위해서 이용되지 않는다. DNA를 구상하는 쉬운 방법은 타래 송곳 모양으로 뒤틀린 광대하게 긴 밧줄 사다리라고 할 수 있다. 사다리의 측은 사다리 (기초)의 가로대가 확고한 사다리의 측에 붙어 있는 각 부속을 가진 2개 부품에서 하는 동안 deoxyribose와 인산염(backbone)의 순서를 교체하고 있다. 가로대에 있는 부분은 수소 접합에 의해 적소에 놓여있는 이종 환식 amine이다. 최대 DNA가 전면적인 이중 나사선으로 존재하더라도, 약간의 세균성 DNA는 주기적인 나선으로 존재한다. 때때로 DNA는 또한 단일 나선으로 존재하기도 한다. 이러한 나선형 구조에 의해서 DNA에는 움푹 페인 곳이 존재하게 되는데, 깊게 페인 부분을 major groove라고 하고, 좀 더 얕게 페인 부분을 minor groove라고 한다. 이들은 protein과 상호 작용을 하는 부분으로써 중요한 역할을 한다. 또한, DNA는 두 개의 antiparalle한 polypeptide 형태로 서로 마주보고 나선 구조를 형성하고 있다.
-Size of a DNA molecule
DNA molecule의 크기는 nucleotide bases의 수천개의 개수의 간격이나 또는 몇 개의 molecule의 base pairs의 간격에 의해서 결정이 된다. 그러므로, 1000개의 base로 구성되어 있는 DNA molecules를 DNA의 1kilobase(kb)라고 할 수 있는 것이다. 만약 DNA가 double helix라면, 하나로 구성된 것 보다는 kilobase pairs(kbp)라고 불리는 것이 더 잘 맞을 것이다. 그러므로, double helix 5000 base pairs의 크기는 5kbp라고 부를 수 있다. 박테리아의 한 종류인 Escherichia coli는 그들의 chromosome에 4640 쌍의 DNA를 가지고 잇다. 이러한 거대한 양의 유전적 sequence정보가 현재 주어진 상태에서, 이것은 종종 base pairs의 수백만개의 언어로 사용될 수 있거나, 또는 이를 megabase pairs(mbp)라고 이야기 한다. E.coli의 유전자는 4.64Mbp이다.
실제적인 길이의 차이는, 각각의 base pair는 helix 상에서 0.34nm 정도의 차이를 나타낸다. 그리고, 각각의 helix의 turn은 10개의 base pairs 마다 하나씩 나타나고 있다. 그러므로, DNA의 1 kilobase는 helix의 100개의 turn과 같고, 이것의 길이는 0.34μm와 같다.
-Inverted repeats, secondary structure, and stem-loop
