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Difference between revisions of "Scoring Matrix"

 
 
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<p>Scoring Matrix<br /><br />Scoring Matrix(측정 행렬)</p>
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<p><font color="#800080" size="3"><strong>Scoring Matrix(측정 행렬)</strong></font></p>
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<p>두개의 서열을 최적으로 배열하는것은 쉽지 않은 작업이다. 가장 높은 scoring alignment를 얻기 위해서는 여러가지 배열들의 점수를 계산하는 방법이 필요하다.<br />예를 들어 두개의 서열이 alignment하는 경우 gap에 대한 점수는 같다고 하지만 두개의 배열은 다를것이다.<br />TATTGACT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; TATTGACT<br />&nbsp; TACGTAA&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; TACGTTA<br />&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; *&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; *&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; *&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; *</p>
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<p>두개의 서열을 최적으로 배열하는것은 쉽지 않은 작업이다. 가장 높은 scoring alignment를 얻기 위해서는 여러가지 배열들의 점수를 계산하는 방법이 필요하다.<br />예를 들어 두개의 서열이 alignment하는 경우 gap에 대한 점수는 같다고 하지만 두개의 배열은 다를것이다.<br />TATTGACT&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; TATTGACT<br />&nbsp; TACGTAA&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; TACGTTA<br />&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; *&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; *&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; *&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; *<br />아미노산들 사이의 생물학적이나 화학적 관계를 방영하여 점수를 매겨야지 좀더 높은 점수 매트릭스를 만들수 있다.&nbsp;<br />측정행렬(Scoring Matrix)는 두 서열을 비교할 때 각각의 아미노산이나 염기들이 일치되거나 혹은 치환될 확률을 각각 계산해 주는 행렬이다.</p>

Latest revision as of 20:26, 21 July 2006

Scoring Matrix(측정 행렬)

두개의 서열을 최적으로 배열하는것은 쉽지 않은 작업이다. 가장 높은 scoring alignment를 얻기 위해서는 여러가지 배열들의 점수를 계산하는 방법이 필요하다.
예를 들어 두개의 서열이 alignment하는 경우 gap에 대한 점수는 같다고 하지만 두개의 배열은 다를것이다.
TATTGACT                    TATTGACT
  TACGTAA                     TACGTTA
      *      *                            *      *
아미노산들 사이의 생물학적이나 화학적 관계를 방영하여 점수를 매겨야지 좀더 높은 점수 매트릭스를 만들수 있다. 
측정행렬(Scoring Matrix)는 두 서열을 비교할 때 각각의 아미노산이나 염기들이 일치되거나 혹은 치환될 확률을 각각 계산해 주는 행렬이다.

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