아미노산 서열의 접히거나 꼬인 구조로써 -NH기와 -C=O기 사이에 일정한 간격으로 수소결합이 이루어지기 때문이다. 2차 구조의 종류는 아미노산 사슬이 나선처럼 감겨진 나선구조와 병풍처럼 접혀진 병풍구조가 있다.
