Difference between revisions of "Gap Penalty"

From Opengenome.net
Line 1: Line 1:
[[Alignment]]에서 [[유전자]]의 상실로 인한 [[Gap]]이 발생할수 있다.<br />이때 진화적으로 처음 Gap의 발생은 어렵지만 Gap이 연장되는것은<br />발생빈도가 높으므로 낮은 [[penalty]]를 받게 된다.<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ<br />A&nbsp; T&nbsp; G&nbsp;C G T&nbsp; A&nbsp; C T&nbsp; G<br />│││││││&nbsp; :&nbsp; ││<br />A&nbsp; T&nbsp; G&nbsp; C G T A&nbsp; A&nbsp; T&nbsp; G<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ
+
[[Alignment]]에서 [[유전자]]의 상실로 인한 [[Gap]]이 발생할수 있다.<br />이때 진화적으로 처음 Gap의 발생은 어렵지만 Gap이 연장되는것은<br />발생빈도가 높으므로 낮은 [[penalty]]를 받게 된다.<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ<br />A T G C G T&nbsp;A&nbsp;C T G<br />│││││││&nbsp; :&nbsp; ││<br />A T&nbsp;G&nbsp;C G T A&nbsp;A&nbsp;T&nbsp;G<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ

Revision as of 20:15, 11 May 2006

Alignment에서 유전자의 상실로 인한 Gap이 발생할수 있다.
이때 진화적으로 처음 Gap의 발생은 어렵지만 Gap이 연장되는것은
발생빈도가 높으므로 낮은 penalty를 받게 된다.
ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ
A T G C G T A C T G
│││││││  :  ││
A T G C G T A A T G
ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ