Difference between revisions of "Gap Penalty"

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Alignment에서 유전자의 상실로 인한 Gap이 발생할수 있다.<br />이때 진화적으로 처음 Gap의 발생은 어렵지만 Gap이 연장되는것은<br />발생빈도가 높으므로 낮은 penalty를 받게 된다.<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ<br />A&nbsp; T&nbsp; G&nbsp;C G T&nbsp; A&nbsp; C T&nbsp; G<br />│││││││&nbsp; :&nbsp; ││<br />A&nbsp; T&nbsp; G&nbsp; C G T A&nbsp; A&nbsp; T&nbsp; G
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Alignment에서 유전자의 상실로 인한 Gap이 발생할수 있다.<br />이때 진화적으로 처음 Gap의 발생은 어렵지만 Gap이 연장되는것은<br />발생빈도가 높으므로 낮은 penalty를 받게 된다.<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ<br />A&nbsp; T&nbsp; G&nbsp;C G T&nbsp; A&nbsp; C T&nbsp; G<br />│││││││&nbsp; :&nbsp; ││<br />A&nbsp; T&nbsp; G&nbsp; C G T A&nbsp; A&nbsp; T&nbsp; G<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ

Revision as of 20:13, 11 May 2006

Alignment에서 유전자의 상실로 인한 Gap이 발생할수 있다.
이때 진화적으로 처음 Gap의 발생은 어렵지만 Gap이 연장되는것은
발생빈도가 높으므로 낮은 penalty를 받게 된다.
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A  T  G C G T  A  C T  G
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A  T  G  C G T A  A  T  G
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