Scoring Matrix

Scoring Matrix

Scoring Matrix(측정 행렬)

두개의 서열을 최적으로 배열하는것은 쉽지 않은 작업이다. 가장 높은 scoring alignment를 얻기 위해서는 여러가지 배열들의 점수를 계산하는 방법이 필요하다.
예를 들어 두개의 서열이 alignment하는 경우 gap에 대한 점수는 같다고 하지만 두개의 배열은 다를것이다.
TATTGACT                    TATTGACT
  TACGTAA                       TACGTTA
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