Difference between revisions of "Mutiple Alignment"
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| − | 다중정렬(Multiple Alignment)<br />다중정렬(multialignment)은 다중서열정렬(multiple sequence alignment)이라고도 하며<br />개 이상의 핵산 또는 단백질 서열을 하나의 정렬로 나타내는 것으로 패밀리(family) 분석, 계통관계(phylogeny) 분석<br />도메인(domain)분석 등의 기능분석(functional analysis) 연구를 위해 매우 다양하게 사용된다.<br />DNA 염기서열 결정이 급속히 진전 되면서 같은 그룹의 여러 개의 핵산이나 단백질 서열에 대한<br />비교가 필요하게 되고 단백질 패밀리나 관련 핵산의 모티프(motif) 서열 등에 대한 자료가 증가하고 <br />기능 분석 연구가 활발해지고 있으므로 효율적인 다중정렬의 필요성이 지속적으로 제기되고 있다<br /><br /><br />ex) 다중정렬<br />Seq1 MAVDPPKADPKGSSGGFHRKSADDPKNGGPALGSREDQSAKAG-CCDPPK<br /> | + | 다중정렬(Multiple Alignment)<br />다중정렬(multialignment)은 다중서열정렬(multiple sequence alignment)이라고도 하며<br />개 이상의 핵산 또는 단백질 서열을 하나의 정렬로 나타내는 것으로 패밀리(family) 분석, 계통관계(phylogeny) 분석<br />도메인(domain)분석 등의 기능분석(functional analysis) 연구를 위해 매우 다양하게 사용된다.<br />DNA 염기서열 결정이 급속히 진전 되면서 같은 그룹의 여러 개의 핵산이나 단백질 서열에 대한<br />비교가 필요하게 되고 단백질 패밀리나 관련 핵산의 모티프(motif) 서열 등에 대한 자료가 증가하고 <br />기능 분석 연구가 활발해지고 있으므로 효율적인 다중정렬의 필요성이 지속적으로 제기되고 있다<br /><br /><br />ex) 다중정렬<br />Seq1 MAVDPPKADPKGSSGGFHRKSADDPKNGGPALGSREDQSAKAG-CCDPPK<br /> | | ||||||| |||||.: ||||||||||||||||| ||. :<br />Seq2 ---DPPKADPKG--GGFHRNARKK-DNGGPALGSREDQSAKAGGCCQWER<br />||||||||| |||||.: ||||||||||||||||| ||||||<br />Seq3 MAVDPPKADPKGSSGGFHRKSADDPKNGGPALGSREDQSAKAG-CCQWER<br />Seq1 ADPKGGSRDRVRRCI RANLLVASLLTV----<br />. |||||||||||||||| ||||<br />Seq2 TAS--GSRDRVRRCI RANLLV--LLTVAAVV<br />||| |||||||||||||||| ||||||||<br />Seq3 TAS--GSRDRVRRCI RANLLV--LLTVAAVV |
Revision as of 20:12, 16 May 2006
다중정렬(Multiple Alignment)
다중정렬(multialignment)은 다중서열정렬(multiple sequence alignment)이라고도 하며
개 이상의 핵산 또는 단백질 서열을 하나의 정렬로 나타내는 것으로 패밀리(family) 분석, 계통관계(phylogeny) 분석
도메인(domain)분석 등의 기능분석(functional analysis) 연구를 위해 매우 다양하게 사용된다.
DNA 염기서열 결정이 급속히 진전 되면서 같은 그룹의 여러 개의 핵산이나 단백질 서열에 대한
비교가 필요하게 되고 단백질 패밀리나 관련 핵산의 모티프(motif) 서열 등에 대한 자료가 증가하고
기능 분석 연구가 활발해지고 있으므로 효율적인 다중정렬의 필요성이 지속적으로 제기되고 있다
ex) 다중정렬
Seq1 MAVDPPKADPKGSSGGFHRKSADDPKNGGPALGSREDQSAKAG-CCDPPK
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Seq2 ---DPPKADPKG--GGFHRNARKK-DNGGPALGSREDQSAKAGGCCQWER
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Seq3 MAVDPPKADPKGSSGGFHRKSADDPKNGGPALGSREDQSAKAG-CCQWER
Seq1 ADPKGGSRDRVRRCI RANLLVASLLTV----
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Seq2 TAS--GSRDRVRRCI RANLLV--LLTVAAVV
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