http://Opengenome.net/index.php?action=history&feed=atom&title=Weight_Matrix 2026-06-09T21:32:39Z Revision history for this page on the wiki MediaWiki 1.31.3 http://Opengenome.net/index.php?title=Weight_Matrix&diff=11703&oldid=prev 2006-07-30T15:14:44Z

<p></p> <p><b>New page</b></p><div>&lt;p&gt;&lt;font color=&quot;#800080&quot; size=&quot;4&quot;&gt;&lt;strong&gt;Weight Matrix&lt;/strong&gt;&lt;/font&gt;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;font color=&quot;#99cc00&quot;&gt;&lt;strong&gt;# Protein Weight Matrix&lt;/strong&gt;&lt;/font&gt;&lt;br /&gt;Protein Weight Matrix는 각 아미노산 잔기들이 이웃하는 아미노산에 대한 유사성을 나타내는 scoring table이다. 이 matrix는 sequece-weight profile score들을 계산하는데 사용한다. 서열들이 밀접하게 관련되었을 때는 동일한 것들과 가장 선호되는 보존적인 치환들에 가장 높은 점수를 부여하는 더 엄격한 matrix가 더 적당하다. 분기된 서열들에 대하여 많은 다른 빈번히 발생하는 치환들에 대하여 높은 점수를 부여하는 softer matrix들이 적당하다.&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;font color=&quot;#99cc00&quot;&gt;&lt;strong&gt;# DNA Weight Matrix&lt;/strong&gt;&lt;/font&gt;&lt;br /&gt;DNA weight matrix는 두개의 hard-coded matrix들을 이용해서 matrix를 작성한다.&lt;br /&gt;1. [[IUB]] : 핵산서열들을 비교하기 위해 BESTFIT를 이용해 작성하는 default scoring matrix이다. X들과 N들은 IUB ambiguity symbol의 어느것에 대하여도 match들로 취급된다.&lt;br /&gt;2. [[CLUSTALW]]를 이용해서 matches scoring matrix를 작성한다.&lt;br /&gt;&lt;/p&gt;</div>

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