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VISTA - Revision history
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Ksjung at 14:39, 30 July 2006
2006-07-30T14:39:12Z
<p></p>
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</tr><tr><td colspan="2" class="diff-lineno" id="mw-diff-left-l2" >Line 2:</td>
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<tr><td class='diff-marker'> </td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p>VISTA 프로그램은 AVID에서 얻어진 [[Sequence Alignment]]결과를 [[annotation]] information과 함께 시각화 시켜주는 프로그램이다.&nbsp;<br />[[JAVA]]로 만들어져 있으며, JAVA를 설치하여 path로 잡아줘야 이용이 가능하다.</p></div></td><td class='diff-marker'> </td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p>VISTA 프로그램은 AVID에서 얻어진 [[Sequence Alignment]]결과를 [[annotation]] information과 함께 시각화 시켜주는 프로그램이다.&nbsp;<br />[[JAVA]]로 만들어져 있으며, JAVA를 설치하여 path로 잡아줘야 이용이 가능하다.</p></div></td></tr>
<tr><td class='diff-marker'> </td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p># option<br />-q turn on quiet mode<br />-d turn on debug mode</p></div></td><td class='diff-marker'> </td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p># option<br />-q turn on quiet mode<br />-d turn on debug mode</p></div></td></tr>
<tr><td class='diff-marker'>−</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p># Plot file format <br />plot file은 VISTA를 실행하기 위해 작성해주는 file로 [[alignment]]결과 file과 <del class="diffchange diffchange-inline">exon의 </del>위치 file, output file의 이름, 기타 옵션으로 구성되어져 있다.<br /></p></div></td><td class='diff-marker'>+</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p># Plot file format <br />plot file은 VISTA를 실행하기 위해 작성해주는 file로 [[alignment]]결과 file과 <ins class="diffchange diffchange-inline">[[exon]]의 </ins>위치 file, output file의 이름, 기타 옵션으로 구성되어져 있다.<ins class="diffchange diffchange-inline"><br /><br /><a href="http://biocc.ngic.re.kr/Biopedia/Biowiki/images/9/9d/VISTA.JPG">http://biocc.ngic.re.kr/Biopedia/Biowiki/images/9/9d/VISTA.JPG</a></ins><br /></p></div></td></tr>
</table>
Ksjung
http://Opengenome.net/index.php?title=VISTA&diff=11698&oldid=prev
Ksjung at 14:38, 30 July 2006
2006-07-30T14:38:40Z
<p></p>
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<td colspan="2" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">Revision as of 14:38, 30 July 2006</td>
</tr><tr><td colspan="2" class="diff-lineno" id="mw-diff-left-l1" >Line 1:</td>
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<tr><td class='diff-marker'>−</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p>VISTA</p></div></td><td class='diff-marker'>+</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p<ins class="diffchange diffchange-inline">><font color="#800080" size="4"><strong</ins>>VISTA<ins class="diffchange diffchange-inline"></strong></font></ins></p></div></td></tr>
<tr><td class='diff-marker'>−</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p>VISTA 프로그램은 AVID에서 얻어진 Sequence <del class="diffchange diffchange-inline">Alignment결과를 </del>annotation information과 함께 시각화 시켜주는 프로그램이다. <del class="diffchange diffchange-inline">JAVA로 </del>만들어져 있으며, JAVA를 설치하여 path로 잡아줘야 이용이 가능하다.</p></div></td><td class='diff-marker'>+</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p>VISTA 프로그램은 AVID에서 얻어진 <ins class="diffchange diffchange-inline">[[</ins>Sequence <ins class="diffchange diffchange-inline">Alignment]]결과를 [[</ins>annotation<ins class="diffchange diffchange-inline">]] </ins>information과 함께 시각화 시켜주는 프로그램이다.<ins class="diffchange diffchange-inline">&nbsp;<br />[[JAVA]]로 </ins>만들어져 있으며, JAVA를 설치하여 path로 잡아줘야 이용이 가능하다.</p></div></td></tr>
<tr><td class='diff-marker'> </td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p># option<br />-q turn on quiet mode<br />-d turn on debug mode</p></div></td><td class='diff-marker'> </td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p># option<br />-q turn on quiet mode<br />-d turn on debug mode</p></div></td></tr>
<tr><td class='diff-marker'>−</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p># Plot file format <br />plot file은 VISTA를 실행하기 위해 작성해주는 file로 <del class="diffchange diffchange-inline">alignment결과 </del>file과 exon의 위치 file, output file의 이름, 기타 옵션으로 구성되어져 있다.<br /></p></div></td><td class='diff-marker'>+</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p># Plot file format <br />plot file은 VISTA를 실행하기 위해 작성해주는 file로 <ins class="diffchange diffchange-inline">[[alignment]]결과 </ins>file과 exon의 위치 file, output file의 이름, 기타 옵션으로 구성되어져 있다.<br /></p></div></td></tr>
</table>
Ksjung
http://Opengenome.net/index.php?title=VISTA&diff=11697&oldid=prev
Ksjung at 14:38, 30 July 2006
2006-07-30T14:38:13Z
<p></p>
<p><b>New page</b></p><div><p>VISTA</p><br />
<p>VISTA 프로그램은 AVID에서 얻어진 Sequence Alignment결과를 annotation information과 함께 시각화 시켜주는 프로그램이다. JAVA로 만들어져 있으며, JAVA를 설치하여 path로 잡아줘야 이용이 가능하다.</p><br />
<p># option<br />-q turn on quiet mode<br />-d turn on debug mode</p><br />
<p># Plot file format <br />plot file은 VISTA를 실행하기 위해 작성해주는 file로 alignment결과 file과 exon의 위치 file, output file의 이름, 기타 옵션으로 구성되어져 있다.<br /></p></div>
Ksjung