Ksjung at 09:13, 13 June 2006

2006-06-13T09:13:22Z

New page

VAST(Vector Alignment Search Tool) VAST는 벡터 정렬 검색 도구로서 3차원 구조에 대한 유사성 지수를 이용해 검색을 수행한다. 2차 구조 요소로부터 파생된 벡터를 사용하므로 서열 정보는 사용하지 않는다. 그래서 서열상의 유사성이 전혀 없는 경우에도 구조 유사성을 찾아내는 경우도 있다. VAST는 [[BLAST]]와 마찬가지로  [[database]]에 등록된 모든 data에 대하여 N*N 형태로 유사성 검색을 수행하게되고, 검색 결과는 Entrez 인터페이스를 이용하여 저장된다. 현재 3차원 구조 database 내에서는 2만개 이상의 도메인 하부구조가 VAST [[알고리즘]]을  사용하여 비교된후 구조와 구조간에 겹쳐보기가 기록되고 겹쳐보기 조각으로 부터 [[서열]] [[정렬]]이 유도된다.

VAST - Revision history

Ksjung at 09:13, 13 June 2006