Ksjung at 07:38, 18 May 2006

2006-05-18T07:38:33Z

New page

NCBI에서 개발한 유니진(UniGene)에서는 [[EST]]와 다른 [[mRNA]] 서열 및 유전체 [[DNA]]에 기능해석을 단 [[코딩 서열]]들([[CDS]])을 관련 서열의 하위 세트로 분류해 놓았다(Boguski & Schuler, 1995). 대부분의 경우 각 [[클러스터]]는 하나의 유전자에 의해 얻어진 서열로 구성되는데, 이 클러스터는 대체접합에 의해 생성된 전사체를 포함하고 있다. 그러나 어떤 [[유전자]]들은 두 개 이상의 클러스터에 의해 나타내어질 수도 있을 것이다. 이 클러스터들은 [[생물체]]에 따라 다르고  최근에는 인간, 마우스, 랫, 힌줄까만송사리와 젖소에 대해서도 만들어져 있다. 이 자료들은 특별한 서열비교  [[알고리즘]]에 근거한 자동화 과정을 사용하여 몇 단계에 걸쳐 만들어져 있다. 이 자료들은 특별한 서열비교 알고리즘에 근거한 자동화 과정을 사용하여 몇 단계에 걸쳐 만들어진다. 첫째, 염기 서열 내부에 [[미토콘드리아]], [[리보솜]], [[벡터 서열]], 반복 요소, 낮은 복잡성 서열 등의 오염이 없는지 조사한다. 이렇게 선별검사가 끝난 서열은 적어도 100개의 염기를 포함하고 있어야 유니진으로 등록될 수 있다. mRNA와 유전체 DNA들은 먼저 유전자 링크로 클러스터된다. 두번째 서열 비교작업에 의해 EST들은 서로 연결되고 유전자 링크에도 연결된다. 이 단계에서 모든 클러스터들은 모아지고, [[polyA]] 를 가진 하나의 서열을 포함하거나 클론의 3'말단으로부터 유래한다고 표시된 두 개의 EST를 포함하게 된다.  마지막으로 연결이 안된 EST들과 크기 1의 유전자 클러스터들은 낮은 엄중도에서 다른 유니진 클러스터들과 비교한다. 유니진은 매주 갱신 되므로 클러스터를 구성하는 서열들도 바뀔 수 있다.

UniGene - Revision history

Ksjung at 07:38, 18 May 2006