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FASTP - Revision history
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Ksjung at 12:21, 24 July 2006
2006-07-24T12:21:58Z
<p></p>
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<td colspan="2" style="background-color: #fff; color: #222; text-align: center;">Revision as of 12:21, 24 July 2006</td>
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<tr><td class='diff-marker'> </td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p><font color="#800080" size="3"><strong>FASTP/ FASTN</strong></font></p></div></td><td class='diff-marker'> </td><td style="background-color: #f8f9fa; color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #eaecf0; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p><font color="#800080" size="3"><strong>FASTP/ FASTN</strong></font></p></div></td></tr>
<tr><td class='diff-marker'>−</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #ffe49c; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p>Lipman, Wilbur, Pearson 등이 hashing과 윈도 설정의 방법을 고안해 만든 FASTP[protein search]와 FASTN[nucleotide search]은 local homology alignment를&nbsp;<br />포함한 [[FASTA]]로 발전하여 데이터베이스를 이용한 [[homology]] search에 사용되며, Altschul과 Karlin이 Homologous candidate fragment선정과&nbsp;<br />extension방법을 이용하여 개발한 [[BLAST]]는 데이터베이스를 이용하여 local homology search를 위한 가장 많이 사용되는 툴이다. 최근 BLAST의 단점인&nbsp;<br />Gap처리가 안되는것을 보안한 <del class="diffchange diffchange-inline">BLAST2가 </del>나와서 BLAST를 대체하고 있다.</p></div></td><td class='diff-marker'>+</td><td style="color: #222; font-size: 88%; border-style: solid; border-width: 1px 1px 1px 4px; border-radius: 0.33em; border-color: #a3d3ff; vertical-align: top; white-space: pre-wrap;"><div><p>Lipman, Wilbur, Pearson 등이 hashing과 윈도 설정의 방법을 고안해 만든 FASTP[protein search]와 FASTN[nucleotide search]은 local homology alignment를&nbsp;<br />포함한 [[FASTA]]로 발전하여 데이터베이스를 이용한 [[homology]] search에 사용되며, Altschul과 Karlin이 Homologous candidate fragment선정과&nbsp;<br />extension방법을 이용하여 개발한 [[BLAST]]는 데이터베이스를 이용하여 local homology search를 위한 가장 많이 사용되는 툴이다. 최근 BLAST의 단점인&nbsp;<br />Gap처리가 안되는것을 보안한 <ins class="diffchange diffchange-inline">[[BLAST2]]가 </ins>나와서 BLAST를 대체하고 있다.</p></div></td></tr>
</table>
Ksjung
http://Opengenome.net/index.php?title=FASTP&diff=11521&oldid=prev
Ksjung at 12:20, 24 July 2006
2006-07-24T12:20:05Z
<p></p>
<p><b>New page</b></p><div><p><font color="#800080" size="3"><strong>FASTP/ FASTN</strong></font></p><br />
<p>Lipman, Wilbur, Pearson 등이 hashing과 윈도 설정의 방법을 고안해 만든 FASTP[protein search]와 FASTN[nucleotide search]은 local homology alignment를&nbsp;<br />포함한 [[FASTA]]로 발전하여 데이터베이스를 이용한 [[homology]] search에 사용되며, Altschul과 Karlin이 Homologous candidate fragment선정과&nbsp;<br />extension방법을 이용하여 개발한 [[BLAST]]는 데이터베이스를 이용하여 local homology search를 위한 가장 많이 사용되는 툴이다. 최근 BLAST의 단점인&nbsp;<br />Gap처리가 안되는것을 보안한 BLAST2가 나와서 BLAST를 대체하고 있다.</p></div>
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