http://Opengenome.net/index.php?action=history&feed=atom&title=CATH 2026-05-07T04:41:22Z Revision history for this page on the wiki MediaWiki 1.31.3 http://Opengenome.net/index.php?title=CATH&diff=11820&oldid=prev 2006-08-17T05:02:02Z

<p></p> <p><b>New page</b></p><div>&lt;p&gt;&lt;font color=&quot;#800080&quot; size=&quot;4&quot;&gt;&lt;strong&gt;CATH&lt;/strong&gt;&lt;/font&gt;&lt;/p&gt;<br /> &lt;p&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp; CATH는 Protein Structure Classification으로 [[SCOP]]과 유사하게 [[PDB]]에 수록된 3D 구조를 분류한 [[domain]] database이다. domain은&amp;nbsp;Detective,&amp;nbsp;&lt;br /&gt;Puu, Domak과 같은 domain 인식 algorithm으로 정의 되어진다. CATH의 이름은 Class, Architecture, Topology, Homologous superfamily에서&amp;nbsp;&lt;br /&gt;유래되었다. Class는 a-구조,b-구조, ab-구조(위의 a/b와 a+b-구조)와 2차 구조의 조성이 낮은 Few Secondary Structures로 정의 하고 있다.&amp;nbsp;&lt;br /&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp; Atchitecture는&amp;nbsp;2D 구조의 공간상에서 배열을 연결한 상태를 배제하고 정의한 것으로 ribbon, sheet, sandwich, roll등이 있다. Topology에는&amp;nbsp;&lt;br /&gt;전체 구조가 2D 구조간의&amp;nbsp;연결 양상을 고려한 분류로 되어있는 Rossmann fold가 있다. Homologous [[superfamily]]는 [[서열 정렬]]과 구조의 비교를&amp;nbsp;&lt;br /&gt;동시에 비교하여 판단한다.&amp;nbsp;&lt;br /&gt;&amp;nbsp;&amp;nbsp; [[서열]]의 [[상동성]]이 높으나 구조의 상동성이 낮거나 그 반대일때 [[단백질]]은 같은 조상으로부터 진화 했을 것이라고 판한하고 있다.&amp;nbsp;&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;&lt;strong&gt;&lt;font color=&quot;#99cc00&quot;&gt;#site&lt;/font&gt;&lt;/strong&gt;&lt;br /&gt;&lt;a href=&quot;http://www.cathdb.info/latest/index.html&quot;&gt;http://www.cathdb.info/latest/index.html&lt;/a&gt;&lt;br /&gt;&lt;a href=&quot;http://www.cathdb.info/images/cath_logo_left.gif&quot;&gt;http://www.cathdb.info/images/cath_logo_left.gif&lt;/a&gt;&lt;/p&gt;</div>

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