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Alignment에서 유전자의 상실로 인한 Gap이 발생할수 있다.<br />이때 진화적으로 처음 Gap의 발생은 어렵지만 Gap이 연장되는것은<br />발생빈도가 높으므로 낮은 penalty를 받게 된다.<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ<br />A T G C G T A C T G<br />│││││││ : ││<br />A T G C G T A A T G<br />ㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡㅡ