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<p><strong><font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">Journal 소개</font><br />
</strong><br />
이 논문은 1999년 Current Opinion in Lipidology에 게재된 논문으로 초창기 동맥경화(atherosclerosis)에 관한 연구를 DNA array와 접목, 소개함<br />
<br />
<br />
<strong><font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">DNA array</font><br />
</strong><br />
- 발병 기전에서 전사 단계에서 일어나는 기작들을 탐지하는 도구 (ex, atherosclerosis)<br />
3) 식품 안전성 평가, 유전병 연구 등<br />
<br />
<strong><font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">Fundamental basis of DNA microarray (complementary binding)</font><br />
[[image: array.jpg]]<br />
<br />
<br />
</strong></p>
<p><strong><font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">Southern Blots vs Northern Blots</font></strong></p>
<p><strong>[[image:southern.gif]] [[image:northern.jpg]]<br />
<br />
<br />
<font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">DNA array = Massively parallel version of Southern & Northern blotting</font> <br />
</strong> Difference <br />
- Southern, Northern Blot<br />
<br />
<br />
<strong><font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">DNA microarray 종류 및 제작 방법<br /></font></strong>- 붙이는 유전 물질의 크기에 따라<br />
1) Oligonucleotide microarray<br />
- 보통 15~25개의 염기들로 이루어진 nucleotide가 microarray 구성<br />
- Stanford 대학에서 처음 개발됨, 주로 pin spotting과 inkjet 방식으로 만듬<br />
<br />
<strong><font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">논문에서 제시한 DNA array formats</font><br />
</strong>[[image:table.jpg]]<br />
<br />
<br />
</p>
<p><strong>AtherosclerosisA<font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">therosclerosis</font></strong></p>
<p>- A multifactorial disease of large, medium sized arteries<br />
- Characterized by <br />
<br />
<br />
<strong><font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">Bioinformatics</font></strong></p>
<p>- Transcriptome (즉, genome내에서의 모든 탐지 가능한 mRNA species의 level) 의 분석은 사용한 array 방법에 상관없이 연구자들에게 생물정보학적인 도구를 요구하기에 이르게 됨<br />
- 엄청난 양의 data는 의미있는 방법을 이용하여 분석되고 표현되어져야 한다는 의견이 모아짐<br />
<br />
<br />
<strong><font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc">Application of DNA arrays in atherosclerosis research</font><br />
<br />
</strong>- 이번 논문에서는 DNA array 기술을 이용하여 atherogenesis 동안 혈관벽의 유전자 발현 패턴을 분석<br />
- 동맥에서의 sample은 심혈관 수술후, 또는 사체로부터 금방 얻음<br />
- DNA array의 normalization은 모든 유전자의 발현 강도 (expression intensity)를 이용하여 수행함<br />
<br />
<strong><font style="BACKGROUND-COLOR: #ff99cc"><br />
Results<br />
<br />
[[image:pig1.jpg]]<br />
</font></strong><br />
<br />
</p>
<p> </p>